小动物CT通过对实验动物（大/小鼠及兔子等中小型动物）进行活体状态下的功能及解剖成像，获得动物身体代谢情况及药物在体内分布情况的各种数据，能够对肿瘤、神经系统、心血管等疾病研究、遗传基因研究以及药物临床前筛选等提供先进的技术支持。 该系统可应用于临床疾病的动物模型建立、早期诊断的分子探针开发、药物的开发、筛选及疗效评价，能够促进基础医学和影像医学研究。
小动物CT检查部位
一、颅内病变：颅内肿瘤、颅部外伤、脑血管病，脑变性疾病、先天性畸形、颅内感染性疾病、脑积水、代谢性疾病。
二、五官：眶内炎症、眼格氏病、眶内肿瘤、眼眶外伤及眶内异物；外耳、中耳、内耳先天性畸形、颞骨外伤、耳硬化症、中耳炎症、颈动脉球瘤；鼻窦炎、鼻窦囊肿及息肉，鼻窦及鼻咽部肿瘤、喉癌、涎腺肿瘤以及炎症。
三、颈部疾病：颈部肿瘤、甲状腺肿瘤、甲状腺弥漫性肿瘤、甲状旁腺肿瘤。
四、胸部：对于显示肺部病变有非常满意的效果，对肺部创伤、感染性病变、肿瘤等均匀有很高的诊断价值。对于纵隔内的肿物、淋巴结以及胸膜病变等的显示也令人满意，可以显示肺内团块与纵隔关系等。
五、腹部：小动物CT对于实质性器官肝脏、胆囊、脾脏、胰腺、肾脏、肾上腺等器官显示清晰，对于肿瘤、感染及创伤能清晰的显示解剖的准确部位病变程度，对病变分期等有较高价值，对腹内肿块的诊断与鉴别诊断价值较大。
六、腹膜后病变：腹膜后肿瘤，腹膜后纤维化，腹主动脉瘤等。
七、盆腔脏器；盆腔器官之间有丰富的脂肪间隔，能准确地显示肿瘤对邻近组织的侵犯，因此CT已成为直肠肿瘤的诊断，临床分期和放射治疗设计的重要手段。
八、脊柱、四肢：脊柱、四肢外伤，骨折，椎管内有无骨折片，椎管有无变形、狭窄，脊柱，四肢炎症，结核，肿瘤，关节退行性病，椎间盘突出等。
九、特殊检查：小动物CT可用于颌面部骨折的三维重建，脑血管及主动脉血管的三维重建，肝脏三期扫描等。
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